В рамках деятельности ПГГПУ существует ряд научных школ, сложившихся в XX и XXI веке. Деятельность научных школ ПГГПУ охватывает различные направления современной науки. Наиболее значимые исследования проводятся в области педагогики и психологии, истории, археологии, физики, филологии, биологии. В настоящее время научные школы включают, как именитых профессоров и доцентов, так и молодых ученых, наиболее заинтересованных в развитии современной науки. Проводимые исследования находят свое отражение в значительном ряде публикаций и патентов.
Научные школы, основанные в ХХ веке:
Пермская научная психологическая школа. Интегральная индивидуальность человека и психолого-педагогическое обеспечение её развития.
Внушение в педагогическом процессе;
Развитие творческого потенциала личности обучающегося в образовательном процессе;
Изучение консортивных отношений и структуры популяций в природных и антропогенных экосистемах;
Физиологическая экология позвоночных животных;
Социально-политические процессы на Урале. ХIХ - ХХ вв..
Новые научные школы, оформившиеся в ХХI веке:
Музыкальное искусство и музыкальное образование: проблемы исторического развития;
Антропоцентрические исследования современной парадигмы международного образования;
Социальное развитие и воспитание в культурологической парадигме образования.